Да, на балконе, петунии - скорее растения ампельные, это нормально, что они вытягиваются.
Петуния - как комнатная герань, может расти много лет. Но зимующих, спящих корневищ - не образует.
Перед заморозками - петунию выкапывают, пересаживают в горшки или ящики - и заносят в теплое помещение.
Там - петуния и зимует, в некоторой прохладе, в светлом месте, при минимальном поливе.
Главное - чтобы не засохла, если немного вытянулась - не страшно.
Ближе к весне, с кустика петунии - отделяют кусочки стволика, с листиками, и укореняют их, в воде или чуть влажной земле.
Маточный куст - тоже можно будет высадить, на грядку или балкон.