Можно и выкопать, лилиям это не повредит.
У лилий, кстати - луковицы должны быть.
Скорее всего - еще и детки в горшке оказаться должны, маленькие.
После выкопки лилий, их луковицы - помещают в пакетики, убирают в холодильник.
Пару месяцев лилии хранятся, потом - можно их вновь высаживать.