Если исключить вирусные заболевания, которые наблюдаются нечасто и не массово, то проблема может быть и в корнях.
Георгины могут расти и даже цвести за счет питательных веществ, накопленных в старых клубнях, тогда как питающие корни развиты очень слабо или совсем погибли.
Причина - недостаток питания, сухость в зоне корней, сильные отклонения в химическом составе почты.
Например, за год до этого - пару ведер золы высыпали, или кислого торфа добавили, или еще что приключилось...